La voie rhinogène est en cause le plus souvent dans des sinusites aiguës après un rhume plus sévère que d'habitude. Une sinusite aigue négligée ou insuffisamment traitée peut alors évoluer en mode chronique.

D'autres maladies touchant les fosses nasales sont parfois en cause.
La plus courante est l'allergie, maladie de la muqueuse par sensibilisation à des allergènes et rendant les muqueuses très inflammatoires et sécrétantes. Maladie générale, elle touche toutes les muqueuse, tant nasales que sinusiennes.

D'autres maladies parfois plus rares sont incriminables telles que la mucoviscidose (maladie génétique perturbant entre autre la qualité du mucus) ou des maladies touchant les cils des cellules nasales et perturbant ainsi leur mobilité et le drainage des sécrétions nasales.

Un bilan spécialisé ORL est donc indispensable tant pour affirmer la présence d'une sinusite chronique que pour déterminer son origine exacte et mettre en route le traitement.